0,00 HUF

Nincsenek termékek a kosárban.

2025. december 28.

Új generációs szekvenálás és a certifikáció

Az utóbbi évtized egyik legnagyobb technológiai újítása a biológiai kutatások terén a nagy áteresztőképességű szekvenálások (high-throughput sequencing – HTS) megjelenése volt. A témáról a szerző a 18. Növényorvos Napon tartott előadást.

Kaliforniában bevált gyakorlat

Maher El Rwahnih, a kaliforniai Davisben működő Foundation Plant Services (FPS) igazgatója mindkét konferencián bemutatta a náluk már működő gyakorlatot. Az FPS nemcsak előállítja, hanem teszteli, fenntartja és forgalmazza is a kórokozómentes szőlő-, gyümölcsfa-, olajfa-, rózsa-, szamóca- és édesburgonya- szaporítóanyagokat. A központ a nemesítési anyagok és az importfajták első szűrőállomása is. 2015 óta évente változó mennyiségű (csak szőlő esetén 40-100) fajta tesztelését kell megoldaniuk, melyek nagy része kezdetben fertőzöttnek bizonyul. Az FPS a biológiai indexelés helyett bevezette és ma már rutinszerűen és az USA hatósága által elfogadottan használja a HTS-t a kiindulási növényanyag tesztelésére. Protokolljuk szerint a beérkező anyagot HTS-sel vizsgálják. Vírusfertőzés esetén először mentesítés történik, hőkezelés utáni mikroszaporítással (hajtáscsúcs-oltás).

Amennyiben a tesztelt növény vírusmentes, egy ideiglenes engedély birtokában máris megkezdődhet a tenyészanyag felszaporítása.

A vírustesztelést a forgalmazási engedély megadása előtt kétszer végzik el HTS-sel és RT-PCR-rel, először a nyugalmi periódus előtt a már fásodott vesszőből háncskaparékból, majd a minimum hathónapos nyugalmi állapot után kihajtó levelek nyeléből. A kérdéses teszteket mindig megismétlik. Ha a növény átesett a vírusmentesítésen, a tesztelés csak egy nyugalmi periódus után kezdhető el, azért, hogy az esetleg a növényben maradó vírus megfelelő koncentrációt érjen el.

A konferencia résztvevői mind egyetértettek abban, hogy közös kutatásokat kell végezni és a módszert közösen optimalizálni, hogy az mihamarabb elfogadottá és engedélyezetté válhasson. Davisben eddig 31 vírust írtak le HTS-sel, de csak egy (GRGV, Grapevine red globe virus) esetében vált szükségessé az azonnali szabályozás. Rámutattak arra, hogy a módszerrel a jelen levő vírusvariánsokról aktuális szekvenciainformációt kaphatunk, a genom változása nyomon követhető, és így az RT-PCR-hez használt primerek szekvenciája felülvizsgálható, aktualizálható.

A kaliforniai cégnél használt rutin bevezetésével a karanténperiódus 3-8 évről 2-3 évre csökken.

Az ideiglenes engedély megadása lehetővé teszi, hogy a kezdetben vírusmentesnek bizonyult fajták szaporítását azonnal megkezdjék, és így a karantén leteltével már forgalmazható mennyiségű szaporítóanyag álljon rendelkezésükre.

A gyümölcsvírusokkal foglalkozó kutatók Wageningenben osztották meg eredményeiket

Még nem automatizálható

Csoportunk 2013-ban, a NAIK Mezőgazdasági Biotechnológiai Intézetének Diagnosztika csoportjaként kezdte el növényi minták (először szőlő) HTS-sel való vizsgálatát vírusdiagnosztikai céllal. A módszer használatával az utóbbi tíz évben számos vírus első hazai előfordulását állapítottuk meg nemcsak termő, hanem szőlő alanyültetvényeken is, illetve gyümölcsösök (kajszi, őszibarack, alma) felmérésekor. A módszert csoportunk alapkutatási kérdések megválaszolására használja, elsősorban a hazánkban előforduló vírusok jelenlétének feltérképezésére.

A szekvenálási szolgáltatások ára a technika folyamatos fejlődése miatt folyamatosan csökken, de a minták előkészítéséhez, az adatok elemzéséhez gyakorlat és szakértelem szükséges, ami még nem automatizálható.

A telepítéskor használt egészséges szaporítóanyag kulcsfontosságú az ültetvények gyors termőre fordulása és hosszú élettartama szempontjából. A szaporítóanyag gazdaságilag fontos kórokozóktól való mentessége csak a megfelelő certifikációs szabályok betartásával valósítható meg. Éppen ezért fontos, hogy ezek a valós veszélyt jelentő kórokozókat szabályozzák és azok kimutatására alkalmas és elérhető lehetőséget javasoljanak. A HTS-t a növényegészségügyben használó kutatók és a növényvédelmi állomások munkatársai folyamatosan dolgoznak a certifikációs szabályozások reformján, ami a közeljövőben biztosan megtörténik. Csak ilyen szabályok betartásával és lehetőségek támogatásával van remény arra, hogy a termesztők tesztelt és káros kórokozóktól mentes szaporítóanyaggal létesítsék az ültetvényeiket, ami a vegetatívan szaporított növények termesztése esetén létfontosságú lenne.

Dr. Várallyay Éva

Forrás: Kertészet és Szőlészet

Szaklap, amelyben a cikk megjelent: