Ugyanakkor az ilyen újítások bevezetése a kezdeti szakaszban kihívásokkal is jár. Sok holland paradicsomtermesztő tapasztalt már zöld, be nem sárguló/pirosodó foltokat a terméseken. Gyakorlati tapasztalatok szerint ez akkor alakul ki, amikor a LED-világítás alatt termesztett növények párologtatása nem elegendő a magas relatív páratartalom, a korlátozott légkeringés és a kevés infravörös hősugárzás miatt. További megfigyelések szerint a nagy fürtös paradicsom tűnik érzékenyebbnek erre.

Amikor a lámpák bekapcsolnak és a fotoszintézis elindul, a „hűvösebb” növény valójában kevesebb vizet és tápanyagot – különösen káliumot – vesz fel, mint ami kívánatos lenne. Kutatók szerint az elégtelenül színeződő termések kialakulásának esélye csökkenthető, ha serkentjük a párologtatást, azaz időben elkezdjük a felfűtést, fenntartjuk a megfelelő káliumfelvételt és a pH nem emelkedik túl magasra.

A távoli vörös fénnyel kapcsolatban a paradicsomtermesztésben korábban sosem végeztek vizsgálatokat, hiszen a hagyományos vörös–kék–zöld spektrum mellett a növények mindig jól teljesítettek. A termesztéstechnológia fejlődésével azonban a megvilágítás intenzitását fokozatosan növelték, és így előfordulhat, hogy a tél közepén a növényeket érő teljes fénymennyiségen belül már nem optimális a távoli vörös fény aránya. Szerencsére a ma elérhető többcsatornás lámpatestekkel könnyen biztosítható valamivel több távoli vörös fény.

Nemcsak a párátlanítás szempontjából (gondoljunk például a koronapenészre a koktélparadicsomnál), hanem a vízszintes és függőleges hőmérséklet-eloszlás tekintetében is. A mérések ugyanis jól mutatják, hogy az üvegházon belül időnként nagyok a hőmérsékletkülönbségek.

A pótmegvilágítás nélküli paradicsomtermesztésben a rezisztens fajtákra való gyors átállás során keresni kell a megfelelő technológiai megoldásokat, hogy a növényből a lehető legtöbbet hozzuk ki. Például ma egyre gyakrabban alkalmaznak két energiafüggönyt a fűtési költségek csökkentésére, de ebben az esetben a páraszabályozásra kimondottan oda kell figyelni.